据中国科学院海洋研究所发布的消息，该所研究员万世明和博士研究生张晋与国内外合作单位发表的最新研究表明，通过南黄海盆地三百米钻探岩芯的沉积记录研究发现，黄海在过去350万年前至80万年前之间长达270万年的时间里主要是陆相盆地，从80万年前以来才发生了大规模海侵而成为黄海，同时黄河开始贯通注入南黄海。
喜马拉雅-青藏高原在约5000万年前印度-欧亚大陆碰撞之后的阶段性隆升被认为强烈地改变了亚洲地形、河流、季风乃至全球气候。东亚边缘海如黄海在新生代（始自距今6500万年）以来接受了黄河、长江等大河输入的上千米巨厚沉积物，因而是研究陆-海相互作用、构造-气候交互影响的关键区域。研究人员以中国大陆架钻探计划在南黄海钻取的长达300米、底部年代达350万年前的连续岩芯为研究材料，通过沉积相、粘土矿物等研究了沉积物来源和黄海古环境演化历史，首次重建了晚上新世（始自距今360万年）以来连续、高分辨率的长江、黄河输入南黄海的历史及黄海大规模海侵的长期记录。
研究提出，黄渤海第四纪的大规模海侵大致同步，发生于约80万年前，据推测，中更新世（约距今100万年至12万年）之前未下沉的闽浙隆起带阻隔了太平洋海水向黄渤海的入侵。此外，这一地区350万年至80万年前物源主要来自于老长江物质，80万年前以来却主要来自于黄河，暗示黄河至少从中更新世就开始影响南黄海。
前人研究认为，长江在2300万年前贯通形成并流入苏北-南黄海盆地，其沉积中心在中更新世左右从苏北-南黄海盆地转移到现今的长江口，暗示了当时长江下游河道和河口三角洲的向南迁移。
黄河的形成演化历史也备受争议，时间从始新世（约距今5300万年至3650万年）到晚更新世（约距今12万年至1万年）不等，但最近从黄河入海的最后构造咽喉——三门峡地层的研究表明，黄河的最终贯通入海时间更可能在中更新世左右，这一年龄和南黄海沉积物源转型时间非常吻合。
